Apteka szpitalna zaopatruje wszystkie oddziały i poradnie Szpitala w produkty lecznicze, środki spożywcze specjalnego przeznaczenia, wyroby medyczne, sterylne i jednorazowe, preparaty biobójcze oraz wykonywane w recepturze jałowej i niejałowej leki recepturowe (maści, zawiesiny, krople do oczu, roztwory, proszki dzielone itp.).

Farmaceuci w niej zatrudnieni mają swój wkład w racjonalizację gospodarki lekiem w szpitalu poprzez okresowe kontrole apteczek oddziałowych czy monitorowanie realizacji umów przetargowych na dostawę asortymentu wydawanego z apteki oraz przygotowywanie przedmiotu zamówienia (jakościowe, ilościowe, wycena) do postępowań przetargowych na dostawę leków i wyrobów medycznych.

Czuwanie nad bezpieczeństwem stosowanych w szpitalu leków i wyrobów medycznych przejawia się ze strony apteki w nadzorze i uczestnictwie w monitorowaniu działań niepożądanych, niespełniania wymagań jakościowych produktów leczniczych, niespełniania wymagań zasadniczych wyrobu medycznego oraz incydentów medycznych z udziałem wyrobów medycznych czy też codziennym nadzorze nad komunikatami (wstrzymania, wycofania, notatki bezpieczeństwa) publikowanymi przez odpowiedzialne instytucje (nadzór farmaceutyczny, urząd rejestracji, komunikaty producenta) i podejmowaniu w określonych przypadkach określonych prawem i wewnętrznymi procedurami działań zwiększających bezpieczeństwo stosowanych leków i wyrobów.

Realizując wymagania ustawy o wyrobach medycznych fachowy personel apteki od 2022 r. archiwizuje kody UDI implantów klasy III dostarczanych do apteki a od 2018r., zgodnie z rozporządzeniem Parlamentu Europejskiego dokonuje codziennie weryfikacji autentyczności dostarczanych leków.

Poza lekami zarejestrowanymi w Polsce farmaceuci apteki szpitalnej uczestniczą i ewidencjonują leki zakupowane w ramach importu docelowego oraz przyjmują i ewidencjonują prawidłowy obrót lekami, próbkami leków, środkami spożywczymi specjalnego przeznaczenia, wyrobami medycznymi przekazywanymi w formie darowizny.

Dodatkowo, personel fachowy apteki prowadzi nadzór nad ewidencją gazów medycznych i odczynników laboratoryjnych.